داستان انیمه دختری که در زمان پرش می‌کرد در مورد دختر نوجوانی به نام موکوتو است که قدرتی شگفت‌انگیز در وجود خود دارد. موکوتو می‌تواند در زمان به گذتشه سفر کند و اتفاقات را طوری که خودش می‌خواهد تغییر دهد! موکوتو پس از کشف این قدرت از آن برای خوشگذرانی و انجام کارهایی که به نفعش است، استفاده می‌کند. اما طولی نمی‌کشد که او با عواقب این کارهای خود مواجه می‌شود و درک می‌کند که این قدرت به منظور دیگری در اختیار او قرار داده شده است...
