داستان انیمیشن دریای عمیق در مورد دختر جوانی است که ماجراجویی بزرگی را به سوی اعماق دریا آغاز میکند. جایی که رازهای بسیاری در آن دفن شدهاند. حالا دخترک کوچک داستان قصد دارد تا به دنیای اسرارآمیز زیر دریا سفر کند و با اتفاقات شگفتانگیزی مواجه شود که...