انیمه دکتر استون درباره یک دانشمند و نابغه علمی به نام سنکو ایشیگامی و دوست تنومندش تایجو است که در دنیایی عجیب به هوش می آیند و می بینند همه آدم ها به مجسمه سنگی تبدیل شده اند. حالا سنگو و دوستش باید به کمک مهارت های خود تمدن بشری را دوباره بازسازی کنند و...