داستان فیلم نفریوس در مورد یک قاتل زنجیره‌ای خطرناک به نام نفریوس است که از سوی دادگاه محکوم به اعدام شده است. در روز اعدام دادگاه خواهان معاینه نفریوس از سوی روانپزشک می‌شود تا شرایط روحی او را ارزیابی کند. همین موضوع سبب می‌شود تا نفریوس تحت ارزیابی روانپزشکی به نام جیمز مارتین قرار بگیرد. در این جلسه روانپزشکی، نفریوس مدعی می‌شود که از سوی شیطان تسخیر شده است. اما داستان از آنجایی جالب می‌شود که نفریوس ادعا می‌کند جیمز مارتین تا پایان جلسه سه نفر را به قتل خواهد رساند...
