در داستان این فیلم، پیتر پارکر جوان متوجه می شود که دفتر خانه پدرش به سرقت رفته است. ریچارد و مری پارکر، والدین پیتر، اسناد مخفی را جمع آوری می کنند، پیتر را به خانه عمه می و عمو بن می برند و به طور مرموزی آنجا را ترک می کنند. سالها بعد، پیتر نوجوان به دبیرستان علوم میدتاون می رود. او عاشق گوئن استیسی است که احساسات او را باز می گرداند. پیتر که می‌فهمد پدرش با دکتر کرت کانرز، دانشمند Oscorp در زمینه ژنتیک بین گونه‌ها دوست است، به اسکورت می‌رود و در آنجا توسط یک عنکبوت اصلاح شده ژنتیکی گزیده می‌شود.
