داستان انیمه قدیسه سسیلیا و کشیش لارنس درباره دختری به نام سسیلیا است که به همراه کشیشی به نام لارنس وظیفه راهنمایی مردم برای دیدن قدیس که نماد اخلاق نیکو است را دارند. اما در این لحظه سسیلیا از این کار خسته شده است و ...