فیلم خون مقدس، حول محور یک هنرمند سابق سیرک به نام فنیکس است که از بیمارستان روانی فرار می کند تا دوباره به مادر خود به نام کونچا که رهبر یک فرقه مذهبی عجیب و غریب است، بپیوندد. هنگامی که فنیکس را همراه با سایر ساکنان آسایشگاه برای یک سفر میدانی به منطقه چراغ قرمز شهر می برند، در آنجا او به طور اتفاقی با زنی از گذشته خود روبرو می شود و فلاش بکی در ذهنش اتفاق می افتد. او در کودکی و زمانی که همراه خانواده اش بازیگر سیرک بودند، شاهد بود که پدرش دستان مادر محبوبش را قطع می کند. او در حال حاضر تحت تاثیر شوک این خاطره تلخ، در یک سری توهمات و رویاها باور میکند که دوباره به مادر بیدستش ملحق شده است. او آغوش مادرش می شود و دو قتل و انتقام وحشتناک را انجام می دهد.
