داستان فیلم گودزیلا پانزده سال پس از اتفاقی که در تاسیسات اتمی افتاده، رخ میدهد. پانزده سال پیش، جو برودی، همسر خود را بر اثر زلزلهای که در تاسیسات اتمی اتفاق افتاد از دست داده است اما حالا او به سرنخهایی مرموز در این مورد دست پیدا کرده است. همین موضوع باعث میشود که جو برودی مشغول به تحقیق در این مورد شود. او در محوطه تاسیسات دستگیر میشود و بر این باور است که همسرش بر اثر زلزله نمرده است. به اعتقاد جو، موجودی عجیب در مرگ همسرش نقش داشته که...
