داستان سریال مگنوم پی آی درباره توماس مگنوم عضو سابق نیروی دریایی است که از افغانستان باز می گردد و تصمیم می گیرد از مهارت های نظامی خود برای تبدیل شدن به یک بازرس خصوصی در هاوایی استفاده کند.