داستان سریال در انتهای شب (در دل شب) در مورد دختری زیبا به نام ماجده است که در یک خانواده فقیر بزرگ شده است. ماجده در زمینه روانشناسی تحصیل کرده و مشغول شفابخشی و کمک به دیگران است اما او به هیچوجه از زندگی شخصی و حرفهای خود راضی نیست. سرانجام ماجده با خانواده ایشیک آشنا میشود؛ خانوادهای موفق که زندگی او را به کلی دستخوش تغییر میکند. در این بین، احمد، پسر خانواده ایشیک، دیوانهوار عاشق ماجده میشود. اما داستان از آنجایی جالب میشود که ماجده، احساساتی نسبت به برادر بزرگتر احمد، کاظم، پیدا میکند. کاظم مرد موفقی است که شهرت بسیاری در کشور دارد. اما مانع بزرگی بر سر راه عشق ماجده نسبت به کاظم وجود دارد؛ این مانع متاهل بودن کاظم است! در این میان عشق احمد نسبت به ماجده نیز برای او دردسرساز شده است تا جایی که...
