فیلم دو پاپ درباره زمانی است که در پشت دیوارهای واتیکان، پاپ محافظه کار بندیکت شانزدهم و پاپ فرانسیس آینده لیبرال باید زمینه های مشترکی جهت ایجاد مسیر جدیدی برای کلیسای کاتولیک پیدا کنند.